Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBNO60934 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBNO60934 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBNO60934 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBNO60934 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBNO60934 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBNO60934 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms