Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms