Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATCO43716 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATCO43716 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATCO43716 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATCO43716 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATCO43716 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATCO43716 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATCO43716 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms