Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ2O43526 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ2O43526 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ2O43526 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ2O43526 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ2O43526 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms