Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASKO14936 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASKO14936 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASKO14936 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASKO14936 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASKO14936 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASKO14936 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASKO14936 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASKO14936 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms