Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QKU1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QKU1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QKU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QKU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QKU1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms