Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3KR12 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3KR12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3KR12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3KR12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3KR12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3KR12 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms