Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L4A6NEF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms