Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIT1Q9Y2X7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIT1Q9Y2X7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms