Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.58■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.54■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP3Q9Y2W1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms