Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBX2Q9Y2T7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms