Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF5Q9Y2D1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF5Q9Y2D1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms