Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms