Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms