Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF9BQ9UPX0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms