Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms