Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF490Q9ULM2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms