Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ZNF608Q9ULD9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF608Q9ULD9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms