Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms