Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYH13Q9UKX3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms