Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms