Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms