Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms