Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms