Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms