Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms