Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms