Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms