Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRIP3Q9NQ35 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms