Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB18Q9NP72 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms