Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A3Q9HC58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms