Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF541Q9H0D2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms