Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms