Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GSX2Q9BZM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSX2Q9BZM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSX2Q9BZM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSX2Q9BZM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GSX2Q9BZM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms