Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms