Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms