Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SYCP2Q9BX26 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYCP2Q9BX26 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms