Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF7Q9BWX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF7Q9BWX1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms