Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUSC1Q9BVN2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUSC1Q9BVN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUSC1Q9BVN2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUSC1Q9BVN2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUSC1Q9BVN2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUSC1Q9BVN2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms