Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NDC1Q9BTX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms