Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
THUMPD2Q9BTF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms