Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYM1Q9BRP8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYM1Q9BRP8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms