Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms