Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms