Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KC1Q96S38 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms