Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms