Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q96MF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q96MF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q96MF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q96MF0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q96MF0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q96MF0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q96MF0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms