Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms