Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLMNQ96JQ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMNQ96JQ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms