Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms